En ese período los cuatro mejor clasificados de las consideradas cuatro mejores ligas de Europa tendrán de manera asegurada plaza fija en el torneo, medida para retrasar y/o evitar su escisión o que antecederá una nueva reestructuración dentro del margen UEFA. Müller estaba en la alineación inicial, y tuvo una oportunidad clave después del descanso, con el Bayern perdiendo 1-0, pero su oportunidad fue frustrada por el portero Júlio César. Bayern vencería en las rondas finales al Magdeburgo con global 5:3, Ararat Ereván con global 2:1, Saint-Étienne con global 2:0, y al Leeds United. Del mismo modo, logró estos títulos en 3 de las 5 Grandes Ligas (Inglaterra, Italia, España) faltándole Alemania y Francia; y en 4 países: Portugal, Inglaterra, Italia, España. El Oporto perdió la Copa de Portugal ante el Benfica en mayo de 2004, pero dos semanas después Mourinho ganó el trofeo más importante a nivel de clubes en Europa, la Liga de Campeones, con una victoria de 3-0 sobre el Mónaco en el Arena AufSchalke en Gelsenkirchen, Alemania. «Los bávaros» procedieron a ganar la Copa de Alemania y la Bundesliga en 2008, estando en las posiciones delanteras en cada semana.

En la edición de 1993-94 volvieron a instaurarse las semifinales tras el sistema de liguilla, el cual se estableció definitivamente y que fue ampliándose paulatinamente de dos a ocho grupos con el devenir de las ediciones. Ocho equipos llegaron como ganadores de su grupo en la ruta de la Champions League, y otros ocho llegaron de un play-off que se realizó entre los ocho segundos equipos de la fase de grupos de la ruta de la Champions League y los ocho equipos que superaron la ruta de Campeones Nacionales. El club logró un registro casi perfecto jugando de local, con ocho puntos de ventaja sobre su más cercano perseguidor y con solo una derrota ante el Gil Vicente. En 1979, el Colonia alcanzó las semifinales de la Copa de Europa, donde cayó ante el Nottingham Forest inglés, a la postre campeón de la competición. También y desde el inicio de la temporada 2012-13, el campeón porta durante la temporada siguiente un emblema de campeón similar al de campeón múltiple con la silueta del trofeo y el año que le señala como campeón vigente, pudiendo portarlo hasta que se proclame vencedor un nuevo equipo.

Campeón del Mundial de Clubes (1º título). Así, la competición no contó con un representante inglés después de que ellos y en especial el Wolverhampton Wanderers Football Club fuesen indirectamente los finales impulsores del torneo. También es el único entrenador en ganar las tres competiciones europeas a nivel de clubes de la UEFA (Liga de Campeones, Liga Europa y Liga Europa Conferencia), así como uno de los cuatro únicos en ganar títulos europeos en tres décadas diferentes -junto a Giovanni Trapattoni, Alex Ferguson, Carlo Ancelotti y Pep Guardiola- y el tercero en llegar a seis finales de competiciones europeas tras Trapattoni y Ferguson. Mourinho escogió a Carlos Mozer, un defensa retirado, como su asistente. En los años 90, regresó a su lugar de origen como asistente en el Vitória de Setúbal. Por ejemplo, él se refirió a una práctica de jog de 20 km como un ejercicio aeróbico extendido. Desde pequeña, fue una goleadora constante y jugó en equipos masculinos. En adición a lo anterior, es importante indicar que Mourinho ha ganado títulos con 6 equipos diferentes: Porto, Chelsea, Inter de Milán, Real Madrid, Manchester United y Roma.

Durante la pretemporada, Mourinho publicó en el website del club los informes detallados de los entrenamientos del equipo, llenos de vocabulario formal. Esto propició que tardase en graduarse, pues este incidente sucedió durante el último año de su educación media. Durante el lapso en que José no asistió a la escuela, su madre -que en realidad quería que él estudiara Administración en vez de Educación Física-, lo inscribió en una escuela privada de Administración. Así se fijó la reanudación de la Liga de Campeones para el mes de agosto, con un formato a partir de cuartos de final a partido único en una misma sede, Lisboa. Lisboa que hoy es la Faculdade de Motricidade Humana de la Universidad Técnica de Lisboa. Sin embargo, por culpa de los preparativos para la final del mundo, el rendimiento del equipo decayó y acabó 3°. Previo al partido de la Intercontinental, Bianchi analizó a su rival, el temible Milan de Fabio Capello liderado por Paolo Maldini y Franco Baresi, que venía de apabullar al Barcelona de Johan Cruyff por la añeja Copa de Europa con un 4-0. “Mejor que ese partido no van a jugar” fue la primera conclusión del técnico velezano.

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